Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms