Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms