Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USB1Q9BQ65 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms