Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VRK1Q99986 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms