Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF11Q99590 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms