Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCT8L2Q96SF2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCT8L2Q96SF2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms