Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms