Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms