Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms