Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms