Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms