Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3L1Q96BA8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms