Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms