Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms