Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms