Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms