Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC4Q8WW27 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms