Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms