Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE22Q8NFJ8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms