Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms