Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms