Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms