Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT12Q8IYM1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms