Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPAP2Q8IXW5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms