Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms