Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms