Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT27Q7Z3Y8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms