Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG9AQ7Z3C6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9AQ7Z3C6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms