Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms