Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHA9Q7RTU4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms