Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREB3L2Q70SY1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3L2Q70SY1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms