Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms