Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms