Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms