Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL3Q6DD88 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms