Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP2LQ5T4T6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms