Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms