Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms