Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms