Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms