Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP6Q16828 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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