Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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