Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ME3Q16798 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ME3Q16798 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms