Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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