Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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