Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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RPE65Q16518 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RPE65Q16518 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RPE65Q16518 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RPE65Q16518 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RPE65Q16518 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RPE65Q16518 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPE65Q16518 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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