Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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