Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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