Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PMCHL1Q16048 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms