Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZFHX3Q15911 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms